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实验室管理水平是衡量疾病预防控制机构检验能力的要素之一，智慧疾控中心LIMS实验室管理系统包括检验业务管理、人员管理、样品采集、样品登记、检测流程管理、设备管理、报告管理、分包管理、费用管理、电子签章和统计分析等功能。因此质量控制始终贯穿于检验工作中,实验室管理信息化使检验流程更加规范统一。
基础管理：包括实验人员基本信息、资质职称信息；角色权限、组织架构、实验室信息、标准方法、原始记录单模版、报告模版、工作流引擎等基础信息维护：
业务受理
①委托方管理包括：基本信息、联系人等信息，以便在委托登记时自动代入委托方信息；
②抽检或送检样品须由委托方填写“样品检验委托书，双方各执一份；
③样品须与“样品检验委托书”填写内容完全一致。样品外观包装完好，送检样品数量应符合检验、复验的要求；
④最后样品接收人员在“样品检验委托书”上签字确认。
样品采集：
实验样品检测、监督由有关业务科室采集，从样品采集开始系统对样品的状态进行实时监控，必须在申请使用的特定位置和时间；到进行的实验次数和检测的样品类别；以及检验结果填报；单次实验的耗材试剂使用情况等，从而保证了检测结果数据的准确度。收样人员收到待检测样品负责统一编制或系统自动生成，将样品的识别标签逐一贴在样品上然后将信息录入系统。支持自定义，样品管理人员可以对样品进行新增、修改、删除操作。
样品检测：疾控中心工作人员可以在线对"样品收发室"对送检的样品与"检测申请单"进行检查。检查内容为是否符合采样要求，手续是否齐全、填写是否规范、数量是否满足、有无变质、损坏，如均符合要求，并在"检测申请单"收样人一栏中签名确认。
分包管理：系统分包可以在系统中指定分包商，记录分包费用，交付分包实验室的样品对方须提供接收凭证，做好样品登记工作。
样品登记：使用RFID标签对样品进行标识，通过条形码读码器扫描样品标签即可显示样品信息，包括：GIS定位、时间、照片、样品名称、编号、数量、陪同人员、使用设备等自动读入LIMS，系统可以完成检品的接收，实现自动盘点，记录。
样品管理：实验人员将采集来的样本留样应按照规定数量、品种执行，打印样品标签，备样、检样，在管理的过程中须将不同检测组别使用不同的标签，危险样品应隔离存放分类保存，具备多级样本分类存储的统计查询管理功能。
耗材管理：实现对耗材入库、验收、注销、领用、统计等业务流程及实验室耗材采购登记与经费智能管控。系统在实验室试剂耗材管理方面确保了试剂耗材的有序传递与检验工作的顺利进行，低值耗材管理的信息化、规范化的高效管理。
检验流程管理：包括但不限于功能模块：业务受理、样品登记、合同评审、样品扫码接收、样品管理、任务分配、结果录入、结果复核、科室审核、报告自动生成、报告审核/批准/打印/发放/归档、检测结果可以实现与监测任务的相关系统进行交互，加快受理的进度。
报告管理：系统支持报告模板自定义设置，能自动生成多种格式的检验报告、评价报告，有效减少手工制作报告所引起的各种错误。还可以批量生成检测报告，报告可以在线电子签章，实验人员依据个人权限对检测结果进行查询、报告查询以及下载。
设备管理：设备使用溯源可查，采购申请、审批、验收，设备档案、领用、保养、维修、校准、期间核查、设备点检、巡检、报废管理，系统可对接设备，自动采集检测数据，当设备位置变化或某台仪器校准超期使用以及出现异常系统会对实验人员进行提醒，校准以及解除故障后支持重新采集。
财务管理：系统检验项目收费功能及项目价格维护功能与财务对接，平台动态管理用户缴费，缴费成功后支持邮件，平台提醒、短信息推送缴费情况，提供收费统计功能。
统计分析：系统自动生成疾控中心日常统计报表，包含日报，月报，季报，年报等自定义操作，疾控中心的监测覆盖率、采样完成率、监测指标完成率、报表合格率、项目完整率等指标，支持样品委托单、样品任务单、样品出入库等自定义组合条件查询以报表（表格）/仪表盘（图形）多种方式展现统计分析结果。
消息推送：系统支持定制检测结果以及检测报告以及各种自定义在线推送服务，平台通过手机、邮件、平台消息等多种方式将最新信息推送给用户，规避因信息滞后影响各种实验采样以及仪器校准过期等问题。
电子签章：系统能够科学应用电子签名、自动加盖电子签章、骑缝章、电子章自由拖动、报告自动生成等系统组件技术，使实验室管理变得更加快捷。通过加密技术防护，保障了签章人电子信息的真实性，实现电子报告的加密和不可篡改以及防伪造等。检测项目、方法、原始记录、管理流程、各类电子表单都由上级疾控中心统一制定，下级疾控中心仅作为系统中的一个用户使用此系统，并按照要求回传数据。
现阶段盛元广通智慧疾控中心LIMS实验室管理系统以实际疾病防控工作需要为基础，辅以智慧疾控实验室信息管理系统LIMS提高管理效率和管理质量，提供对样品检验的流程化管理，符合ISO/IEC 17025对实验室的规范管理要求，各环节可共享样品的各种信息，填补了实验室检验检测工作信息化管理的空白，确保了各检测环节质量控制的检测力度，同时可靠性，及时性以及准确性得到了保障。